คริสตจักรพระสัญญา จังหวัดสมุทรปราการ ก่อตั้งขึ้นจากความมุ่งมั่นและความเชื่อของกลุ่มผู้รับใช้พระเจ้า โดยมีจุดเริ่มต้นจากงานประกาศข่าวประเสริฐของนายศุภชัย วงศ์ธนาธิกุล นักศึกษาจากโรงเรียนพระคริสตธรรมแบ๊บติสต์ เพลินจิต ในปี ค.ศ. 1961 เขาได้ติดตามแหม่มคลายไปประกาศในหลายจังหวัด และหลังจากสำเร็จการศึกษาในปี ค.ศ. 1962 ก็เริ่มทำงานประกาศที่จังหวัดสมุทรปราการ โดยได้รับการสนับสนุนจากมูลนิธิแบ๊บติสต์แห่งประเทศไทยและคริสตจักรอิมมานูเอล
ในปี ค.ศ. 1963 สถานประกาศ “อิมมานูเอลปากน้ำ” ได้ย้ายไปยังบ้านริมน้ำของท่านอาจารย์อนงค์ นิมานเหมินทร์ เนื่องจากสถานที่เดิมไม่เพียงพอต่อผู้สนใจเรียนภาษาอังกฤษและรวีวารศึกษา ต่อมาในปี ค.ศ. 1965 อาจารย์มูลี่และครูศุภชัยได้วางแผนซื้อที่ดินเพื่อก่อตั้งคริสตจักร และในปี ค.ศ. 1967 มูลนิธิแบ๊บติสต์แห่งประเทศไทยได้ซื้อที่ดินปัจจุบันเพื่อสร้างคริสตจักร
อาคารนมัสการเสร็จสมบูรณ์ในปี ค.ศ. 1968 และสถาปนาเป็น “คริสตจักรพระสัญญา” โดยครูศุภชัย วงศ์ธนาธิกุล ดำรงตำแหน่งศิษยาภิบาลคนแรก คริสตจักรได้เติบโตขึ้นอย่างต่อเนื่อง และในปี ค.ศ. 1976 ครูศุภชัยได้รับการแต่งตั้งเป็นศาสนาจารย์ ภายใต้การนำของเขา คริสตจักรได้จัดโครงการฝึกอาชีพเพื่อช่วยเหลือสมาชิก และขยายงานประกาศไปยังชุมชนรอบข้าง
ในปี ค.ศ. 1988 คริสตจักรพระสัญญามีสมาชิก 152 คน และได้ปรับปรุงอาคารนมัสการให้จุผู้คนได้มากขึ้น สะท้อนถึงความเติบโตของคริสตจักรผ่านความเชื่อและการทุ่มเทของชุมชน คริสตจักรพระสัญญายังคงดำเนินพันธกิจประกาศข่าวประเสริฐและสร้างชีวิตผู้คนให้เติบโตในความเชื่อจนถึงปัจจุบัน
